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刘志瑾

作者: | 来源: | 发布日期:2021-03-17 | 阅读次数:

刘志瑾

 

理学博士

 

联系方式:

Email: liuzj@ioz.ac.cn; Mobile phone: 13466318269

 

个人简历

1980年出生,博士,副研究员。2002年进入中国科学院动物研究所攻读硕士和博士学位,并于2007年获生态学博士学位,2010年晋升副研究员。2021年调入立博体育工作。目前主要从事灵长类动物和哺乳动物的演化与生态基因组学、生物信息学和保护基因组学等生物大数据研究。目前担任中国动物学会灵长类学分会副秘书长、中国动物学会兽类学分会副秘书长、Journal of Primatology编委和国际动物学会灵长类工作组成员。2011年-2012年作为访问学者访问德国灵长类研究中心,为期一年。2015年-2016年作为访问学者访问英国卡迪夫大学,为期一年。

 

学习工作经历

2002年-2007年,中国科学院动物研究所,硕博连读,导师:魏辅文院士、李明研究员

2007年-2009年,中国科学院动物研究所,动物生态与保护生物学院重点实验室,助理研究员

2010年-2020年,中国科学院动物研究所,动物生态与保护生物学院重点实验室,副研究员

2021年至今,立博体育,生命科学学院,副研究员

 

获科技奖情况

2007年,北京市青年优秀科技论文一等奖,市级奖励。

2009年,中国科学院卢嘉锡青年人才奖,院级奖励。

2009年,优秀青年动物生态学工作者,动物生态学术专业委员会。

2011年,中国科学院首批青年创新促进会会员

 

研究成果和研究方向

研究成果:

1. 生态与保护生物学方面,发现人类活动造成了野生灵长类动物的种群遗传隔离和衰退,揭示了保护力度不均衡是我国灵长类动物保护存在的巨大问题,确定了保护的5个优先区域 Molecular EcologyBiological ConservationConservation BiologyPLoS One等)。

2. 演化与基因组学方面,提出了哺乳动物食性特化的“进化漩涡假说”,揭示了叶猴类通过改变钙离子信号通路基因编码适应高钙的生活环境,以及灵长类动物体色变异、形态差异的关键基因(Molecular Biology and Evolution, GiGaScience, Frontiers in Zoology等)。

 

近期工作计划:

近期继续关注脊椎动物离子信号通路和免疫相关基因,揭示其在适应特殊生境中的演化适应规律。揭示基因组中蛋白编码区与非编码区在演化适应中的不同作用。将研究成果与人类健康研究结合起来。

 

长期的研究计划:

主要以生物信息学为研究手段,整合分子细胞生物学研究方法,继续探讨脊椎动物在演化过程中基因型与表型和环境的相互关系,同时将计算生物学和实验生物学两个方面结合到一起,打造生物信息学新阶段的研究体系。

 

主持科研项目

国家自然科学面上基金5

1. No.31970390乌叶猴属(Trachypithecus)物种系统发育基因组学与适应演化研究,2020-2023年,62万。

2. No.31772438白头叶猴及其近缘种的分化历史和毛色差异的基因组学研究,2018-2021年,62万。

3. No.31471989猕猴(Macaca mulatta)亚种及其近缘种比较基因组学研究,2015-2018年,85万。

4. No.31272301猴科味觉受体tas1rs基因家族分子进化机制与食性相关性研究,2013-2016年,83万。

5. No.30970376黑叶猴保护遗传学与进化历史研究2010-2012年,32万。

中国科学院先导专项子课题1项:

XDA23080201旗舰动物种群动态监测与产地溯源,2019-2022年,240万。

科技部重点研发计划“珍稀动物濒危机制及保护技术研究”子课题1项:

灵长类动物濒危的遗传学过程及其适应的分子生态机理,2016-2020年,100万。

 

科研成果 (第一作者或通讯作者,#共同第一,*通讯作者):

 

1. Zhijin Liu#,*, Liye Zhang#, Zhongze Yan#, Zhijie Ren#, Fengming Han#, Xinxin Tan, Zhiyuan Xiang, Fang Dong, Zuomin Yang, Guangjian Liu, Ziming Wang, Jiali Zhang, Tengcheng Que, Chaohui Tang, Yifeng Li, Song Wang, Junyi Wu, Legong Li, Chengming Huang, Christian Roos*, Ming Li*. 2020. Genomic mechanisms of physiological and morphological adaptations of limestone langurs to karst habitats. Molecular Biology and Evolution, 37: 952-968. [5年影响因子:13.401, JCR 一区]

2. Zhijin Liu*. 2020. Global view on virus infection in non-human primates and implication for public health and wildlife conservation during the SARS-CoV-2 epidemic. bioRixv.

3. Xumao Zhao, Baoping Ren, Dayong Li, Paul A. Garber, Pingfen Zhua, Zuofu Xiang, Cyril C. Grueter, Zhijin Liu*, Ming Li*. 2019. Climate change, grazing, and collecting accelerate habitat contraction in an endangered primate. Biological Conservation, 231:88-97. [5年影响因子: 5.278, JCR 二区]

4. Zhijin Liu#,*, Huamei Wen#, Frank Hailer3#, Fang Dong#, Zuomin Yang, Tao Liu, Ling Han, Fanglei Shi, Yibo Hu*, Jiang Zhou*. 2019. Pseudogenization of Mc1r gene associated with transcriptional changes related to melanogenesis explains leucistic phenotypes in Oreonectes cavefish (Cypriniformes, Nemacheilidae). Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research, 57: 900-909. [5年影响因子: 2.321, JCR 二区]

5. Zhijin Liu#, Xinxin Tan#, Pablo Orozco-terWengel# , Xuming Zhou, Liye Zhang, Shilin Tian, Zhongze Yan, Huailiang Xu, Baoping Ren, Peng Zhang, Zuofu Xiang, Binghua Sun, Christian Roos, Michael W. Bruford*, and Ming Li*. 2018. Population genomics of wild Chinese rhesus macaques reveals a dynamic demographic history and local adaptation, with implications for biomedical research. GigaScience, 7:1-14. [5年影响因子:7.441, JCR 二区]

6. Xuming Zhou#, Xuehong Meng#, Zhijin Liu#,…Ming Li*. 2016. Population Genomics Reveals Low Genetic Diversity and Adaptation to Hypoxia in Snub-Nosed Monkeys. Molecular Biology and Evolution, 33(10):2670–2681. [5年影响因子:13.002, JCR 一区]

7. Zhijin Liu#,*, Guangjian Liu#, Frank Hailer#, Pablo Orozco-terWengel#, Xinxin Tan#, Jundong Tian, Zhongze Yan, Baowei Zhang and Ming Li*. 2016. Dietary specialization drives multiple independent losses and gains in the bitter taste gene repertoire of Laurasiatherian Mammals. Frontiers in Zoology, 13: 28. [5年影响因子:3.664, JCR 二区]

8. Zhijin Liu#, Guangjian Liu#, Christian Roos, Ziming Wang, ZuoFu Xiang, Pingfen Zhu, Boshi Wang, Baoping Ren, Fanglei Shi, Huijuan Pan, and Ming Li* . 2015. Implications of genetics and current protected areas for conservation of 5 endangered primates in China. Conservation Biology, 29: 1508-1517. [封面文章5年影响因子:5.807, JCR 二区]

9. Guangjian Liu, Lutz Walter, Suni Tang, Xinxin Tan, Fanglei Shi, Huijuan Pan, Christian Roos*, Zhijin Liu* and Ming Li. 2014. Differentiated adaptive evolution, episodic relaxation of selective constraints, and pseudogenization of umami and sweet taste genes TAS1Rs in catarrhine primates. Frontiers in Zoology, 11: 79. [5年影响因子:3.986, JCR 二区]

10. Zhijin Liu#, Boshi Wang#, Tilo Nadler, Guangjian Liu, Tao Sun, Chengming Huang, Qihai Zhou, Jiang Zhou, Tengcheng Que, Ziming Wang, Christian Roos*, Ming Li *. 2013. Relatively recent evolution of pelage coloration in Colobinae: phylogeny and phylogeography of three closely related langur species. PLoS ONE, 8: e61659. [5年影响因子:4.015]

11. Zhijin Liu, C. M. Huang*, Q. H. Zhou, Y. B. Li, Y. F. Wang, M. Li, O. Takenaka, A. Takenaka. 2013. Genetic Analysis of Group Composition and Relatedness in White-headed Langurs. Integrative Zoology, 8: 410-416. [5年影响因子:1.743, JCR 二区]

12. Zhijin Liu, Baoping Ren, Ruidong Wu, Liang Zhao, Yanli Hao, Boshi Wang, Fuwei Wei, Yongcheng Long, Ming Li*. 2009. The Effect of Landscape Features on Population Genetic Structure in Yunnan snub-nosed monkeys (Rhinopithecus bieti) implies an anthropogenic genetic discontinuity. Molecular Ecology, 18: 3831–3846. [5年影响因子:6.369, JCR 二区]

13. Zhijin Liu, Baoping Ren, Yanli Hao, Hongrong Zhang, Fuwen Wei, Ming Li*. 2008. Identification of 13 Human Microsatellite Markers Cross-Species Amplification for Fecal Samples from Yunnan snub-nosed monkey (Rhinopithecus bieti). International Journal of Primatology, 29:265–272. [5年影响因子:2.105]

14. Zhijin Liu, Baoping Ren, Fuwen Wei, Yongcheng Long, Yanli Hao, Ming Li*. 2007. Phylogeography and Population History of Yunnan snub-nosed Monkey (Rhinopithecus bieti) Inferred from Mitochondrial Control Region DNA Sequence Analysis. Molecular Ecology, 16: 3334–3349. [封面文章, 5年影响因子:6.040, JCR 二区]

15. Zhijin Liu, Baowei Zhang, Fuwen Wei, Ming Li. 2005. Isolation and characterization of microsatellite loci for the red panda, Ailurus fulgens. Molecular Ecology Notes, 5: 27-29. [5影响因子:1.219]

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